Posted by on 1 listopada 2018

Identyfikacje nukleotydowe i liczby lat między początkowymi izolacjami wirusów grypy A i ich najbliższymi krewnymi osadzonymi w bazie danych NCBI. Panel A pokazuje skumulowaną proporcję sekwencji o danym stopniu identyczności nukleotydów z ich najbliższym krewnym. Panel B pokazuje łączną proporcję sekwencji występujących w danej liczbie lat po zidentyfikowaniu najbliższego krewnego. Figura 2 pokazuje tożsamości nukleotydów i liczby lat między początkową izolacją danej sekwencji wirusa grypy A zdeponowanej w bazie danych NCBI a początkową izolacją jej najbliższego krewnego. Łącznie 98% wszystkich sekwencji ludzkich wirusów grypy A ma krewnych z co najmniej 99% identycznością nukleotydów, a 95% ma krewnego, który został początkowo wyizolowany w ciągu 2 lat przed ich pierwszym pojawieniem się. Te liczby sugerują, że naukowcy pobrali efektywnie wirusy ludzkiej grypy A i wskazują na wysoki stopień jednorodności wśród ludzkich wirusów grypy A. Wirusy świńskiej grypy A nie były tak samo wydajne jak wirusy ludzkiej grypy A; Niemniej jednak, 86% wszystkich segmentów takich szczepów ma krewnych z co najmniej 99% identycznością nukleotydów, a 71% ma krewnego, który został początkowo wyizolowany w ciągu 2 lat przed pierwszym pojawieniem się. Tylko 2% wszystkich sekwencji wirusa świńskiej grypy A ma 94% identyczności nukleotydów z ich najbliższym krewnym, aw 2% przypadków najbliższa krewna pojawiła się co najmniej 20 lat wcześniej.
Ryc. 3. Ryc. 3. Numery sekwencji wirusów grypy A z ludzkich i trzody chlewnej izolowanych na różnych kontynentach i osadzonych w bazie danych NCBI. Pobieranie próbek zwiększyło się w ostatnich latach. Żadne sekwencje szczepów wirusa świńskiej grypy A z Afryki, Oceanii lub Ameryki Południowej nie zostały zdeponowane w bazie danych.
Rysunek 4. Rysunek 4. Identyfikacja nukleotydów grypy ludzkiej i świńskiej grypy A (H1N1) w Ameryce Północnej, Europie i Azji oraz poza nią. Szczepy wirusa ludzkiej grypy A wykazują silną jednorodność na całym świecie. Północnoamerykańskie i europejskie szczepy wirusa świńskiej grypy A są jednorodne na każdym kontynencie. Szczepy wirusa azjatyckiej grypy świń typu A zawierają domieszkę szczepów północnoamerykańskich i europejskich.
Figura 3 pokazuje liczby sekwencji z gospodarzy ludzkich i świńskiej izolowanych na różnych kontynentach i zdeponowanych w bazie danych NCBI. Liczby wzrosły dramatycznie w ciągu ostatnich kilku lat, a geografia odgrywa ważną rolę. Większość izolatów wirusów grypy ludzkiej A pochodzi z Ameryki Północnej, Oceanii, Azji i Europy. Chociaż istnieje wiele wirusów świńskiej grypy A z Ameryki Północnej, Azji i Europy, nie ma ich wcale w Afryce, Oceanii i Ameryce Południowej. Wirusy amerykańskiej i europejskiej grypy świń (H1N1) wykazują silną homogeniczność geograficzną, podczas gdy niektóre azjatyckie izolaty zawierają domieszkę zarówno linii północnoamerykańskich, jak i europejskich (ryc. 4). Chociaż wirusy grypy ludzkiej A podróżują z gospodarzami na całym świecie, wirusy świńskiej grypy na różnych kontynentach mają w dużej mierze odrębne rodowody.
Biorąc pod uwagę zarówno zależność rozmieszczenia wirusów świńskiej grypy A na położeniu geograficznym, jak i brak pobierania próbek w niektórych częściach świata, być może nie jest zaskakujące, że przodkowie nowego wirusa ludzkiej grypy A (H1N1) pozostawali niezauważeni prawie od samego początku. dwie dekady Tylko skuteczniejszy nadzór mógłby zapobiec takiemu zdarzeniu w przyszłości.
Finansowanie i ujawnianie informacji
Nie zgłoszono żadnego potencjalnego konfliktu interesów związanego z tym artykułem.
Ten artykuł (10.1056 / NEJMp0904572) został opublikowany 27 maja 2009 r., O godz.
Author Affiliations
Z Departamentu Informatyki Biomedycznej, Centrum Biologii Obliczeniowej i Bioinformatyki, Columbia University College of Physicians and Surgeons, Nowy Jork.

[hasła pokrewne: badanie kału cena, baza lekarzy w polsce, informacja o lekach telefon ]

Powiązane tematy z artykułem: badanie kału cena baza lekarzy w polsce informacja o lekach telefon

Posted by on 1 listopada 2018

Identyfikacje nukleotydowe i liczby lat między początkowymi izolacjami wirusów grypy A i ich najbliższymi krewnymi osadzonymi w bazie danych NCBI. Panel A pokazuje skumulowaną proporcję sekwencji o danym stopniu identyczności nukleotydów z ich najbliższym krewnym. Panel B pokazuje łączną proporcję sekwencji występujących w danej liczbie lat po zidentyfikowaniu najbliższego krewnego. Figura 2 pokazuje tożsamości nukleotydów i liczby lat między początkową izolacją danej sekwencji wirusa grypy A zdeponowanej w bazie danych NCBI a początkową izolacją jej najbliższego krewnego. Łącznie 98% wszystkich sekwencji ludzkich wirusów grypy A ma krewnych z co najmniej 99% identycznością nukleotydów, a 95% ma krewnego, który został początkowo wyizolowany w ciągu 2 lat przed ich pierwszym pojawieniem się. Te liczby sugerują, że naukowcy pobrali efektywnie wirusy ludzkiej grypy A i wskazują na wysoki stopień jednorodności wśród ludzkich wirusów grypy A. Wirusy świńskiej grypy A nie były tak samo wydajne jak wirusy ludzkiej grypy A; Niemniej jednak, 86% wszystkich segmentów takich szczepów ma krewnych z co najmniej 99% identycznością nukleotydów, a 71% ma krewnego, który został początkowo wyizolowany w ciągu 2 lat przed pierwszym pojawieniem się. Tylko 2% wszystkich sekwencji wirusa świńskiej grypy A ma 94% identyczności nukleotydów z ich najbliższym krewnym, aw 2% przypadków najbliższa krewna pojawiła się co najmniej 20 lat wcześniej.
Ryc. 3. Ryc. 3. Numery sekwencji wirusów grypy A z ludzkich i trzody chlewnej izolowanych na różnych kontynentach i osadzonych w bazie danych NCBI. Pobieranie próbek zwiększyło się w ostatnich latach. Żadne sekwencje szczepów wirusa świńskiej grypy A z Afryki, Oceanii lub Ameryki Południowej nie zostały zdeponowane w bazie danych.
Rysunek 4. Rysunek 4. Identyfikacja nukleotydów grypy ludzkiej i świńskiej grypy A (H1N1) w Ameryce Północnej, Europie i Azji oraz poza nią. Szczepy wirusa ludzkiej grypy A wykazują silną jednorodność na całym świecie. Północnoamerykańskie i europejskie szczepy wirusa świńskiej grypy A są jednorodne na każdym kontynencie. Szczepy wirusa azjatyckiej grypy świń typu A zawierają domieszkę szczepów północnoamerykańskich i europejskich.
Figura 3 pokazuje liczby sekwencji z gospodarzy ludzkich i świńskiej izolowanych na różnych kontynentach i zdeponowanych w bazie danych NCBI. Liczby wzrosły dramatycznie w ciągu ostatnich kilku lat, a geografia odgrywa ważną rolę. Większość izolatów wirusów grypy ludzkiej A pochodzi z Ameryki Północnej, Oceanii, Azji i Europy. Chociaż istnieje wiele wirusów świńskiej grypy A z Ameryki Północnej, Azji i Europy, nie ma ich wcale w Afryce, Oceanii i Ameryce Południowej. Wirusy amerykańskiej i europejskiej grypy świń (H1N1) wykazują silną homogeniczność geograficzną, podczas gdy niektóre azjatyckie izolaty zawierają domieszkę zarówno linii północnoamerykańskich, jak i europejskich (ryc. 4). Chociaż wirusy grypy ludzkiej A podróżują z gospodarzami na całym świecie, wirusy świńskiej grypy na różnych kontynentach mają w dużej mierze odrębne rodowody.
Biorąc pod uwagę zarówno zależność rozmieszczenia wirusów świńskiej grypy A na położeniu geograficznym, jak i brak pobierania próbek w niektórych częściach świata, być może nie jest zaskakujące, że przodkowie nowego wirusa ludzkiej grypy A (H1N1) pozostawali niezauważeni prawie od samego początku. dwie dekady Tylko skuteczniejszy nadzór mógłby zapobiec takiemu zdarzeniu w przyszłości.
Finansowanie i ujawnianie informacji
Nie zgłoszono żadnego potencjalnego konfliktu interesów związanego z tym artykułem.
Ten artykuł (10.1056 / NEJMp0904572) został opublikowany 27 maja 2009 r., O godz.
Author Affiliations
Z Departamentu Informatyki Biomedycznej, Centrum Biologii Obliczeniowej i Bioinformatyki, Columbia University College of Physicians and Surgeons, Nowy Jork.

[hasła pokrewne: badanie kału cena, baza lekarzy w polsce, informacja o lekach telefon ]

Powiązane tematy z artykułem: badanie kału cena baza lekarzy w polsce informacja o lekach telefon