Posted by on 6 listopada 2018

Swoistość tego testu serologicznego potwierdzono poprzez badanie 40 próbek surowicy pobranych od pacjentów z gorączką; wszystkie próbki były ujemne. W celu potwierdzenia, surowicę miareczkowano w zwalidowanym rutynowym oznaczeniu immunofluorescencyjnym do wykrywania przeciwciał swoistych dla borowirusa. Wyniki
Analiza metagenomiczna
Analiza metagenomiczna wykazała pięć fragmentów sekwencji, które miały 70,3% do 81,2% identyczności z izolatami gatunku Bornavirus z gatunku Ssak w próbkach L00652 (wątroba, płuca i nerki) i L00651 (płyn w klatce piersiowej) (Tabela S5 w dodatkowym dodatku) . Ukierunkowane badania przesiewowe sekwencji odczytuje się z pozostałych pul dodatkowo wykrytych 23 odczytów związanych z sekwencjami bornavirusa ssaka (tożsamość pomiędzy 67,6% a 81,7%) (Tabela S5 w Dodatku Aneks). Fragmenty były spokrewnione z sekwencjami bornaawirusa zarówno ssaka, jak i ptaka, a wirus został wstępnie nazwany borowirusiem wiewiórki różnobarwnej (VSBV-1). Brutalne badanie patologiczne wiewiórki nie ujawniło żadnych konkretnych zmian; jednak histologicznie stwierdzono, że mózg ma satelitozę i łagodną aktywację glejową.
Analiza RT-qPCR w czasie rzeczywistym
Tabela 2. Tabela 2. Wyniki RT-qPCR w czasie rzeczywistym dla próbek otrzymanych z wiewiórki i trzech pacjentów. Z użyciem dwóch niezależnych systemów RT-qPCR, RNA VSBV-1 znaleziono w różnych materiałach próbnych od wiewiórki iw próbki dostępne od wszystkich trzech pacjentów (tabela 2). Wysokie obciążenia RNA VSBV-1 obserwowano w próbkach mózgu, serca, płuca, nerek i wymazów z jamy ustnej i gardła u wiewiórek. W przeciwieństwie do tego, w krwi traktowanej EDTA i płynie klatki piersiowej wykryto jedynie niskie obciążenia RNA VSBV-1. Pośrednie obciążenia genomem wirusowym można stwierdzić w próbkach mózgu FFPE z Pacjentów i 2. Analiza świeżo zamrożonego materiału od Pacjenta 3 ujawniła wysokie ładunki RNA VSBV-1 w mózgu (Tabela 2). We wszystkich badaniach genom VSBV-1 można było wykryć tylko wtedy, gdy zastosowano testy obejmujące odwrotną transkrypcję; wyniki pozostały negatywne w testach bez odwrotnej transkrypcji. Ponadto wszystkie materiały kontrolne od pacjentów z niespokrewnionymi chorobami mózgu i od osób zdrowych były ujemne w obu systemach PCR.
Sekwencjonowanie całego genomu i analiza filogenetyczna
Rycina 2. Rycina 2. Analiza filogenetyczna przedstawicieli rodzaju Bornavirus, w tym Borowirusy domniemanych odmian wiewiórki (VSBV-1). Drzewo filogenetyczne zostało wywiedzione na podstawie kompletnych sekwencji kodujących za pomocą łańcucha bayesowskiego Markov Metoda Monte Carlo i równolegle metody łączenia sąsiadów i maksimum wiarygodności. Statystyczne wsparcie grupowania od prawdopodobieństwa Bayesa z posteriori (wiarygodność kladu .90%) i 1000 powtórzeń łączenia sąsiadów i maksimum prawdopodobieństwa (.70%) jest oznaczone gwiazdką. Informacje dotyczące taksonu zawierają skrót wirusa, numer dostępu do GenBank i rok wykrycia. Gałęzie są barwione zgodnie z rodowodem (w obrębie klasyfikacji gatunków i nomenklatury borowirusów zaproponowanej przez Międzynarodowy Komitet ds. Taksonomii Wirusów Bornaviridae Study Group, 7 z wyjątkiem VSBV-1 [próbne, niesklasyfikowane borowirusy])
[hasła pokrewne: leki dla seniorów, dialab wyniki online, baza lekarzy w polsce ]

Powiązane tematy z artykułem: baza lekarzy w polsce dialab wyniki online leki dla seniorów

Posted by on 6 listopada 2018

Swoistość tego testu serologicznego potwierdzono poprzez badanie 40 próbek surowicy pobranych od pacjentów z gorączką; wszystkie próbki były ujemne. W celu potwierdzenia, surowicę miareczkowano w zwalidowanym rutynowym oznaczeniu immunofluorescencyjnym do wykrywania przeciwciał swoistych dla borowirusa. Wyniki
Analiza metagenomiczna
Analiza metagenomiczna wykazała pięć fragmentów sekwencji, które miały 70,3% do 81,2% identyczności z izolatami gatunku Bornavirus z gatunku Ssak w próbkach L00652 (wątroba, płuca i nerki) i L00651 (płyn w klatce piersiowej) (Tabela S5 w dodatkowym dodatku) . Ukierunkowane badania przesiewowe sekwencji odczytuje się z pozostałych pul dodatkowo wykrytych 23 odczytów związanych z sekwencjami bornavirusa ssaka (tożsamość pomiędzy 67,6% a 81,7%) (Tabela S5 w Dodatku Aneks). Fragmenty były spokrewnione z sekwencjami bornaawirusa zarówno ssaka, jak i ptaka, a wirus został wstępnie nazwany borowirusiem wiewiórki różnobarwnej (VSBV-1). Brutalne badanie patologiczne wiewiórki nie ujawniło żadnych konkretnych zmian; jednak histologicznie stwierdzono, że mózg ma satelitozę i łagodną aktywację glejową.
Analiza RT-qPCR w czasie rzeczywistym
Tabela 2. Tabela 2. Wyniki RT-qPCR w czasie rzeczywistym dla próbek otrzymanych z wiewiórki i trzech pacjentów. Z użyciem dwóch niezależnych systemów RT-qPCR, RNA VSBV-1 znaleziono w różnych materiałach próbnych od wiewiórki iw próbki dostępne od wszystkich trzech pacjentów (tabela 2). Wysokie obciążenia RNA VSBV-1 obserwowano w próbkach mózgu, serca, płuca, nerek i wymazów z jamy ustnej i gardła u wiewiórek. W przeciwieństwie do tego, w krwi traktowanej EDTA i płynie klatki piersiowej wykryto jedynie niskie obciążenia RNA VSBV-1. Pośrednie obciążenia genomem wirusowym można stwierdzić w próbkach mózgu FFPE z Pacjentów i 2. Analiza świeżo zamrożonego materiału od Pacjenta 3 ujawniła wysokie ładunki RNA VSBV-1 w mózgu (Tabela 2). We wszystkich badaniach genom VSBV-1 można było wykryć tylko wtedy, gdy zastosowano testy obejmujące odwrotną transkrypcję; wyniki pozostały negatywne w testach bez odwrotnej transkrypcji. Ponadto wszystkie materiały kontrolne od pacjentów z niespokrewnionymi chorobami mózgu i od osób zdrowych były ujemne w obu systemach PCR.
Sekwencjonowanie całego genomu i analiza filogenetyczna
Rycina 2. Rycina 2. Analiza filogenetyczna przedstawicieli rodzaju Bornavirus, w tym Borowirusy domniemanych odmian wiewiórki (VSBV-1). Drzewo filogenetyczne zostało wywiedzione na podstawie kompletnych sekwencji kodujących za pomocą łańcucha bayesowskiego Markov Metoda Monte Carlo i równolegle metody łączenia sąsiadów i maksimum wiarygodności. Statystyczne wsparcie grupowania od prawdopodobieństwa Bayesa z posteriori (wiarygodność kladu .90%) i 1000 powtórzeń łączenia sąsiadów i maksimum prawdopodobieństwa (.70%) jest oznaczone gwiazdką. Informacje dotyczące taksonu zawierają skrót wirusa, numer dostępu do GenBank i rok wykrycia. Gałęzie są barwione zgodnie z rodowodem (w obrębie klasyfikacji gatunków i nomenklatury borowirusów zaproponowanej przez Międzynarodowy Komitet ds. Taksonomii Wirusów Bornaviridae Study Group, 7 z wyjątkiem VSBV-1 [próbne, niesklasyfikowane borowirusy])
[hasła pokrewne: leki dla seniorów, dialab wyniki online, baza lekarzy w polsce ]

Powiązane tematy z artykułem: baza lekarzy w polsce dialab wyniki online leki dla seniorów

Posted by on 6 listopada 2018

Co najmniej dwóch pacjentów zostało porysowanych przez ich wiewiórki w przeszłości, a jednego ugryziono. Ponieważ wstępne badanie przesiewowe wiewiórki z populacji lęgowej Pacjenta 3 nie ujawniło żadnego z badanych patogenów (szczegóły w Tabeli S3 Dodatku Uzupełniającego) przeanalizowano panel próbek od wiewiórki za pomocą sekwencjonowania metagenomicznego. Wszystkie dalsze analizy opierały się na wykryciu kilku krótkich fragmentów sekwencji z silnym podobieństwem do bornaawirusa Mammalian 1. Metody
Próbki tkanek i płynów ustrojowych
Pobrano próbki organów, krwi, wymazu z jamy ustno-gardłowej i próbki płynu z klatki piersiowej zdrowej, barwnej wiewiórki, która miała bezpośredni kontakt z Pacjentem 3 w celu przeprowadzenia analiz. Ponadto przetestowano zarchiwizowaną tkankę mózgową utrwaloną w formalinie, zatopioną w parafinie (FFPE) od pacjentów i 2, a także świeżo zamrożone próbki mózgu, płyn mózgowo-rdzeniowy i surowicę od Pacjenta 3. Tkanka mózgowa FFPE od 10 niespokrewnionych ludzi (tkanka od pacjentów z chorobą Alzheimera, encefalopatią wywołaną przez ludzki wirus upośledzenia odporności lub zapaleniem mózgu wywołanym przez wirusa opryszczki pospolitej, jak również z normalną tkanką mózgową), materiały z reakcji polimerazy (PCR) -negatywne barwne wiewiórki i mózg konia zainfekowanego chorobą Borna (BoDV) zostały użyte jako materiał kontrolny.
Metagenomika, sekwencjonowanie całego genomu i analiza sekwencji
Metagenomiczna analiza próbek wiewiórki została przeprowadzona zgodnie ze standardowym przepływie pracy, jak opisano w innym miejscu.

(więcej…)

Be the first to comment.

Powiązane tematy z artykułem: leczenie kanałowe pod mikroskopem cennik ośrodek terapii uzależnień warszawa stomatologia estetyczna rzeszów

Posted by on 6 listopada 2018

W latach 2011-2013 trzy hodowcy różnobarwnych wiewiórek (Sciurus variegatoides) chorowały na zapalenie mózgu z podobnymi objawami klinicznymi i zmarły od 2 do 4 miesięcy po wystąpieniu objawów klinicznych. Przy zastosowaniu podejścia metagenomicznego, które obejmowało sekwencjonowanie następnej generacji i ilościową reakcję łańcuchową polimerazy z odwrotną transkryptazą w czasie rzeczywistym (RT-qPCR), wykryto obecność nieznanego wcześniej borowirusa w kontaktowej wiewiórce i w próbkach mózgu z trzech pacjenci. Analizy filogenetyczne wykazały, że wirus ten, nazwany wstępnie borowirusem różnobarwnych wiewiórek (VSBV-1), tworzy linię oddzielną od linii znanych gatunków borowirusów. (Finansowane przez Federalne Ministerstwo Żywności i Rolnictwa [Niemcy] i inne.)
Wprowadzenie
Rycina 1. Rycina 1. Obrazowanie metodą rezonansu magnetycznego. W panelu A obrazowanie zobrazowania T2 (z sekwencją odzyskiwaniem płynu z inwersją płynu [FLAIR]) wykazuje zmiany hiperintensywne w lewym jądrze podstawnym i płatu potylicznym Pacjenta 2 (strzałki).

(więcej…)

Be the first to comment.

Powiązane tematy z artykułem: kalkulator gfr mdrd motylki pro ana blog poradnia wad postawy